Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03732 and BSU25000
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03732 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:43
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03732___pbpA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU25000___pbpA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03732___pbpA-BSU25000___pbpA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03732___pbpA-BSU25000___pbpA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03732___pbpA
# 2: BSU25000___pbpA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2151
# Identity: 2136/2151 (99.3%)
# Similarity: 2136/2151 (99.3%)
# Gaps: 0/2151 ( 0.0%)
# Score: 10620.0
#
#
#=======================================
BSNT_03732___ 1 ATGAGGAGAAATAAACCAAAAAAGCAAAATCATAAAGAGAAAAAGAAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1 ATGAGGAGAAATAAACCAAAAAAGCAAAATCATAAAGAGAAAAAGAAGTC 50
BSNT_03732___ 51 GCTTCCGATCCGGCTGAATATTTTATTTTTAGCTGCCTTTGTTATATTCA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU25000___pb 51 GCTTCCGATCCGGCTGAATATTTTATTTTTAGCTGCCTTTGTTATATTTA 100
BSNT_03732___ 101 CCTGGATTATTGTGGAACTGGGCATCAAGCAGATCGTGCAAGGCGATGAT 150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU25000___pb 101 CCTGGATTATTGTGGAACTGGGCATCAAGCAGATCGTGCAAGGTGATGAT 150
BSNT_03732___ 151 TACAAAAACCAAGCGAATAAGCAGGAACAAAGTGAAGTCAGCTCAGCGGT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 151 TACAAAAACCAAGCGAATAAGCAGGAACAAAGTGAAGTCAGCTCAGCGGT 200
BSNT_03732___ 201 ACCACGCGGGAAAATTTATGATCGAAACTTTAATGCCATTGTGACAAATA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 201 ACCACGCGGGAAAATTTATGATCGAAACTTTAATGCCATTGTGACAAATA 250
BSNT_03732___ 251 AGGCTTTAAATGCAATCACATACACGAGATCTAAATCGACCACGCAAGAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 251 AGGCTTTAAATGCAATCACATACACGAGATCTAAATCGACCACGCAAGAA 300
BSNT_03732___ 301 CAGCGCTTAAAGATCGCAAAAAAGCTGTCTGACATGATCAAAGTCGATAC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 301 CAGCGCTTAAAGATCGCAAAAAAGCTGTCTGACATGATCAAAGTCGATAC 350
BSNT_03732___ 351 AAAAAAAGTAACAGAACGGGATAAAAAAGATTATTGGATTTTGACTAGAC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 351 AAAAAAAGTAACAGAACGGGATAAAAAAGATTATTGGATTTTGACTAGAC 400
BSNT_03732___ 401 CGAAAGAAGCGAAAAAGCTCATTAGCTCTAAAGAAAGACAGCAGGTTGAA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 401 CGAAAGAAGCGAAAAAGCTCATTAGCTCTAAAGAAAGACAGCAGGTTGAA 450
BSNT_03732___ 451 GACAAAAAAATATCCGATGACGATTTATACCAGCTTCAGCTAAAACGGAT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 451 GACAAAAAAATATCCGATGACGATTTATACCAGCTTCAGCTAAAACGGAT 500
BSNT_03732___ 501 TACTGATAAGCAGCTGAATGAATTGACGGATAAAGATATGCAGATCCTCG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU25000___pb 501 TACTGATAAGCAGCTGAATGAATTGACGGATAAAGATATGCAGATCCTTG 550
BSNT_03732___ 551 CTATCAAAAGGCGTATGGATTCAGGCTATGCTTTGACCCCTCAATATATT 600
||||||||||.|..||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
BSU25000___pb 551 CTATCAAAAGACAGATGGATTCGGGCTATGCATTGACCCCTCAATATATC 600
BSNT_03732___ 601 AAAAATGAGGATGTATCAGCGAAGGAAATGGCAGTGGTAAGTGAACATTT 650
|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 601 AAAAACGAAGATGTATCAGCGAAGGAAATGGCAGTGGTAAGTGAACATTT 650
BSNT_03732___ 651 AGACGAACTGCCAGGTGTTGATGTCACGTCCGATTGGGAACGTGAATATC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 651 AGACGAACTGCCAGGTGTTGATGTCACGTCCGATTGGGAACGTGAATATC 700
BSNT_03732___ 701 CGTATAAAAACCTTCTTCGCTCAGTGCTCGGAAGTGTGTCCAGCTCTAAT 750
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU25000___pb 701 CTTATAAAAACCTTCTTCGCTCAGTGCTCGGAAGTGTTTCCAGCTCTAAT 750
BSNT_03732___ 751 GAAGGATTGCCGTCCAACTTGCTCGACCATTATCTGTCGCTTGGCTACAG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 751 GAAGGATTGCCGTCCAACTTGCTCGACCATTATCTGTCGCTTGGCTACAG 800
BSNT_03732___ 801 CCGAAATGACAGGGTCGGAAAAAGCTATCTGGAATACCAATATGAAAGCC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 801 CCGAAATGACAGGGTCGGAAAAAGCTATCTGGAATACCAATATGAAAGCC 850
BSNT_03732___ 851 TTCTGCAGGGCCAAAAAGCAAAAGTCGAAAATATCACAGATTCAAAAGGC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 851 TTCTGCAGGGCCAAAAAGCAAAAGTCGAAAATATCACAGATTCAAAAGGC 900
BSNT_03732___ 901 AATGTCACGGGAACAAAAACGGTATCTGAAGGCAAAGCCGGGAAAGATCT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 901 AATGTCACGGGAACAAAAACGGTATCTGAAGGCAAAGCCGGGAAAGATCT 950
BSNT_03732___ 951 TGTACTAACAATTGATATTGATTTGCAAAAATCAGTGGAAAAAATTATTG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 951 TGTACTAACAATTGATATTGATTTGCAAAAATCAGTGGAAAAAATTATTG 1000
BSNT_03732___ 1001 AGAAAAAACTTAAAGCTGCTAAAGCAAGACCTAGTACCGAATTGTTGGAT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1001 AGAAAAAACTTAAAGCTGCTAAAGCAAGACCTAGTACCGAATTGTTGGAT 1050
BSNT_03732___ 1051 CGTGCATTCGTTGTCATGATGGACCCTAGAAACGGCGAAGTGCTGACAAT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1051 CGTGCATTCGTTGTCATGATGGACCCTAGAAACGGCGAAGTGCTGACAAT 1100
BSNT_03732___ 1101 GGCAGGGAAGCAGATTAAACGAGAAAATGGAGCCTATAAGTTTGATGATT 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1101 GGCAGGGAAGCAGATTAAACGAGAAAATGGAGCCTATAAGTTTGATGATT 1150
BSNT_03732___ 1151 ATGCATTAGGAGCCATGACTTCATCCTACGCTATGGGATCAGCTGTAAAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1151 ATGCATTAGGAGCCATGACTTCATCCTACGCTATGGGATCAGCTGTAAAA 1200
BSNT_03732___ 1201 GGTGCAACCGTTTTGACCGGTCTTCAAACTGGAGCGATTAATTTGAATAC 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1201 GGTGCAACCGTTTTGACCGGTCTTCAAACTGGAGCGATTAATTTGAATAC 1250
BSNT_03732___ 1251 TGTATTTAAGGATGAACCATTGTATATCGGCCAGGATAAAAGAGGGAAAA 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1251 TGTATTTAAGGATGAACCATTGTATATCGGCCAGGATAAAAGAGGGAAAA 1300
BSNT_03732___ 1301 AATCTTGGCAAAACTTAGGGCCGGTTGGTATTCAAACTGCATTAGAGAAG 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1301 AATCTTGGCAAAACTTAGGGCCGGTTGGTATTCAAACTGCATTAGAGAAG 1350
BSNT_03732___ 1351 TCATCAAACGTTTTTATGTTTAAAACAGCTATTGCAGTTGGTAAAGGTGA 1400
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1351 TCATCAAACGTTTTTATGTTTAAAACAGCAATTGCAGTTGGTAAAGGTGA 1400
BSNT_03732___ 1401 ATATAAACCTCACCAAGCATTGCCTTTGGATACTTCTGCATTTGATACCT 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1401 ATATAAACCTCACCAAGCATTGCCTTTGGATACTTCTGCATTTGATACCT 1450
BSNT_03732___ 1451 TCAGAAATTATTTCAGTCAATTTGGATTAGGAGTAAAAACAGGAATTGAT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1451 TCAGAAATTATTTCAGTCAATTTGGATTAGGAGTAAAAACAGGAATTGAT 1500
BSNT_03732___ 1501 CTACCAAATGAAATGACGGGATATAAAGGTACAAGCAGATTATCTGGTTT 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1501 CTACCAAATGAAATGACGGGATATAAAGGTACAAGCAGATTATCTGGTTT 1550
BSNT_03732___ 1551 CTTGCTTGATTTCGCCATTGGACAGTATGATACTTATACACCGCTGGAAT 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1551 CTTGCTTGATTTCGCCATTGGACAGTATGATACTTATACACCGCTGGAAT 1600
BSNT_03732___ 1601 TGGCTCAATATGTCTCCACCATAGCAAATGGTGGCTACCGCATGAAGCCT 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1601 TGGCTCAATATGTCTCCACCATAGCAAATGGTGGCTACCGCATGAAGCCT 1650
BSNT_03732___ 1651 CAGCTTGTAAAGGAAGTCAGAGATTCAAATGCGAAAAAAGGGATCGGCGC 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1651 CAGCTTGTAAAGGAAGTCAGAGATTCAAATGCGAAAAAAGGGATCGGCGC 1700
BSNT_03732___ 1701 AGTCGTTGATTCTGTTCAGCCTGAAGTATTGAATAAAGTCGATATGAAGA 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1701 AGTCGTTGATTCTGTTCAGCCTGAAGTATTGAATAAAGTCGATATGAAGA 1750
BSNT_03732___ 1751 GTAGCTATATTGAAGAGGTCCAAGCCGGTTTTAGACGGGTTGCCACTAAA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1751 GTAGCTATATTGAAGAGGTCCAAGCCGGTTTTAGACGGGTTGCCACTAAA 1800
BSNT_03732___ 1801 GGGACAGCTGCAGGTCAACTGGCTTCAGCATCGTATAAACCAGCTGCAAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1801 GGGACAGCTGCAGGTCAACTGGCTTCAGCATCGTATAAACCAGCTGCAAA 1850
BSNT_03732___ 1851 AACAGGAACAGCCCAATCATTTTACGACGGACCGGATAAATCAAAAACAG 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1851 AACAGGAACAGCCCAATCATTTTACGACGGACCGGATAAATCAAAAACAG 1900
BSNT_03732___ 1901 GAACAGACACTTATAATACGACGCTTGTGGCTTATGCACCAGCTGACAAT 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1901 GAACAGACACTTATAATACGACGCTTGTGGCTTATGCACCAGCTGACAAT 1950
BSNT_03732___ 1951 CCTGAGATTGCTATTTCTGTCGTAGTTCCTTGGACTTACATTGATTACAA 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 1951 CCTGAGATTGCTATTTCTGTCGTAGTTCCTTGGACTTACATTGATTACAA 2000
BSNT_03732___ 2001 TCAAAGATACTCAATTACAAACGAAATCGGCAGGGAAGTAATGGATAAAT 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 2001 TCAAAGATACTCAATTACAAACGAAATCGGCAGGGAAGTAATGGATAAAT 2050
BSNT_03732___ 2051 ATTTTGAGCTGAAATCGAAGCAGGACAAAGAAGATACTCAGCAAAAGAAT 2100
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU25000___pb 2051 ATTTTGAGCTGAAATCGAAGCAGGACAAAGAAGGTACTCAGCAAAAGAAT 2100
BSNT_03732___ 2101 AAAGACAAAATTGAAGAAAATGCAGAAAACACAACGTCTTCTGATAACTA 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25000___pb 2101 AAAGACAAAATTGAAGAAAATGCAGAAAACACAACGTCTTCTGATAACTA 2150
BSNT_03732___ 2151 A 2151
|
BSU25000___pb 2151 A 2151
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.