Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_00059 and BSU00270
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_00059 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:15:54
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_00059___yaaO.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU00270___yaaO.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_00059___yaaO-BSU00270___yaaO.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_00059___yaaO-BSU00270___yaaO.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00059___yaaO
# 2: BSU00270___yaaO
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1443
# Identity: 1420/1443 (98.4%)
# Similarity: 1420/1443 (98.4%)
# Gaps: 0/1443 ( 0.0%)
# Score: 7008.0
#
#
#=======================================
BSNT_00059___ 1 ATGAACACACCTTTATATAAAGCATTAATTCAACATGCGAGAAGAAATTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 1 ATGAACACACCTTTATATAAAGCATTAATTCAACATGCGAGAAGAAATTC 50
BSNT_00059___ 51 TCATTCATTTCATGTTCCGGGACATCACAATGGAGATGTCTTTTTTGATG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 51 TCATTCATTTCATGTTCCGGGACATCACAATGGAGATGTCTTTTTTGATG 100
BSNT_00059___ 101 ACGCTAAGTCAATATTCGATCCGCTTCTCACCATTGATGTAACTGAACTG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 101 ACGCTAAGTCAATATTCGATCCGCTTCTCACCATTGATGTAACTGAACTG 150
BSNT_00059___ 151 GCAGGATTGGATGATCTCCATCATCCTTCCGGGGTGATTAAGGAAGCTCA 200
||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 151 GCAGGACTGGATGATCTCCATCATCCTTCTGGGGTGATTAAGGAAGCTCA 200
BSNT_00059___ 201 GGAGCTTGTCAGTCAATTATATGGATCGGCGGAAAGTTTTTTTCTGGTAA 250
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 201 GGAGCTTGCCAGTCAATTATATGGATCGGCGGAAAGTTTTTTTCTGGTAA 250
BSNT_00059___ 251 ATGGTACGACTGTCGGAAACTTAGCGATGATTTTATCTGTTTGTGAACCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 251 ATGGTACGACTGTCGGAAACTTAGCGATGATTTTATCTGTTTGTGAACCT 300
BSNT_00059___ 301 GGTGATACAATTCTGGTTCAAAGAAACTGTCATAAATCTGTATTTCATGC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 301 GGTGATACAATTCTGGTTCAAAGAAACTGTCATAAATCTGTATTTCATGC 350
BSNT_00059___ 351 TGTTGATTTGGCCGGTGCTAAGCCGGTTTATCTTGCACCTGACGTTGATT 400
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 351 TGTTGATTTGTCCGGTGCTGAGCCGGTTTATCTTGCACCTGACGTTGATT 400
BSNT_00059___ 401 CAGCGATGCATGTGCCTACGCATGTTCCGCTTGGAACAATTAAAGAGGCC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 401 CAGCGATGCATGTGCCTACGCATGTTCCGCTTGGAACAATTAAAGAGGCC 450
BSNT_00059___ 451 CTGGAAGCATATCCAGATGCGAAAGGCTTGGTACTGACCAATCCGACATA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 451 CTGGAAGCATATCCAGATGCGAAAGGCTTGGTACTGACCAATCCGACATA 500
BSNT_00059___ 501 TTACGGACATAGTGCTGATTTGACTGAGATCATTACTGAAGCCCATCATT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 501 TTACGGACATAGTGCTGATTTGACTGAGATCATTACTGAAGCCCATCATT 550
BSNT_00059___ 551 ACGGGATTCCTGTTTTGGTCGATGAAGCGCATGGCGCACATTTTATTTTA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 551 ACGGGATTCCTGTTTTGGTCGATGAAGCGCATGGCGCACATTTTATTTTA 600
BSNT_00059___ 601 GGTGAGCCTTTTCCGGTCTCAGCTTTAAAAATGGGGGCAGATATTGTTGT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 601 GGTGAGCCTTTTCCGGTCTCAGCTTTAAAAATGGGGGCAGATATTGTTGT 650
BSNT_00059___ 651 TCAGTCGGCCCACAAAACGTTGCCTGCCATGACGATGGGTTCTTATTTGC 700
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 651 TCAGTCGGCCCACAAAACGTTGCCAGCCATGACGATGGGTTCTTATTTGC 700
BSNT_00059___ 701 ATCTTAACAGCAGCTGCAGGATTAACAGGGATCGGGTGGCAGAGTATTTA 750
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 701 ATCTCAACAGCAGCTGCAGGATTAACAGGGATCGGGTGGCAGAGTATTTA 750
BSNT_00059___ 751 AACCGATTACAAAGCAGCAGCCCGTCTTATCCGATAATGGCTTCGTTAGA 800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU00270___ya 751 AACCGATTACAAAGCAGCAGCCCGTCTTATCCGATTATGGCTTCGTTAGA 800
BSNT_00059___ 801 TATTGCCCGCGCTTATGTACAGCATATTATAGAAGAACAAAAGCTTTCTG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 801 TATTGCCCGCGCTTATGTACAGCATATTATAGAAGAACAAAAGCTTTCTG 850
BSNT_00059___ 851 ACATTCTGCAGCGGATACAAACACTTAAACAAACGTTTGATTCACTTACA 900
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 851 ACATTCTGCAGCGGATAGAAACACTTAAACAAACGTTTGATTCACTTACA 900
BSNT_00059___ 901 AATGCAGAAGCTGTTAACCCTGCTAATCCACTGATCATCACGGACCCGCT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU00270___ya 901 AATGCAGAAGCTGTTAACCCTGCTAATCCACTGATCATCACGGATCCGCT 950
BSNT_00059___ 951 GAAGCTCACAATTCGTTCAAAACGCGGGCATTCTGGCTATACGCTGCAAA 1000
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 951 AAAGCTCACAATTCGTTCAAAACGCGGGCATTCTGGCTATACGCTGCAAA 1000
BSNT_00059___ 1001 GCATATTAGAGCGTGCCAACATATTCACTGAGCTTGCTGATGAAAATCAA 1050
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 1001 GCATTTTAGAGCGTGCCAACATATTCACTGAGCTTGCTGATGAAAATCAA 1050
BSNT_00059___ 1051 GTTCTGCTCGTTCTCCCATTGGGGGGAAAACGGAGAATAAATGCTGAAAC 1100
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.
BSU00270___ya 1051 GTTCTGCTCGTTCTCCCATTGGGAGGAAAACGGAGAATAAACGCTGAAAT 1100
BSNT_00059___ 1101 CATTAGAAGCATTGATGAAAAGATTGAGAAAACGCCTCCGGATCAGGCGT 1150
||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU00270___ya 1101 CATTAGAAGCATCGATGAAGAGATTGAGAAAACGCCTCCGGATCAGACGT 1150
BSNT_00059___ 1151 TTGTTTCTGCAGAATGGGGAGTGCAGCCTGTTACTGTCTTGCCTTATCCA 1200
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 1151 TTGTTTCTGCAGAATGGGGTGTGCAGCCTGTTACTGTCTTGCCTTATCCA 1200
BSNT_00059___ 1201 AAAAAGGTCTTACATTCGTTTAAGAAAGAATATGTGGACTTTGAGGAAGC 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||
BSU00270___ya 1201 AAAAAGGTCTTACATTCGTTTAAGAAAGAATATGTGAGCTTTGAGGAAGC 1250
BSNT_00059___ 1251 AACTGGCCGGCTGAATGCAGAAGATATCATCCCTTATCCTCCGGGTATCC 1300
|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 1251 AGCTGGCCGGCTTAATGCAGAAGATATCATCCCTTATCCTCCGGGTATCC 1300
BSNT_00059___ 1301 CGATGATTATGGCGGGAGAAAGAATAACAAAAGAAAGTGTGCAAAAGCTC 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 1301 CGATGATTATGGCGGGAGAAAGAATAACAAAAGAAAGTGTGCAAAAGCTC 1350
BSNT_00059___ 1351 AGCCGCTTGATCAGCATGAAAACGCATGTTCAAGGGAATATGAAAATCAA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 1351 AGCCGCTTGATCAGCATGAAAACGCATGTTCAAGGGAATATGAAAATCAA 1400
BSNT_00059___ 1401 AGAGAAACAACTACTTGTTTATATAGAAGAGGAGAAATCATGA 1443
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00270___ya 1401 AGAGAAACAACTACTTGTTTATATAGAAGAGGAGAAATCATGA 1443
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.